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Modsencode-toolkit

encode-toolkit 0.3.4 不可变快照最新

固定到提交 36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c，采集于 。

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全部版本

当前包简介（非历史快照）

20 ENCODE API tools + 47 expert skills for genomics research. Search experiments, download files with MD5 verification, run pipelines, and cross-reference 14 databases.

安装

这个版本出现在已验证的市场清单 ammawla（仓库 ammawla/encode-toolkit）中。在 Claude Code 里依次执行：

  1. 添加市场/plugin marketplace add ammawla/encode-toolkit
  2. 安装插件/plugin install encode-toolkit@ammawla

这些命令安装的是上游市场的当前状态，不是本页固定的提交快照，两者可能不同。

内容 65

技能47
子代理7
命令10
MCP 服务器1
依赖、兼容性与技能声明

已记录的依赖 0

未从 plugin.json 或市场条目记录依赖要求。这里只显示随快照保存的清单字段；其他文件里的依赖声明不在当前采集范围内。

已记录的兼容要求

本快照没有从 plugin.json 或市场条目记录兼容性要求。这里只显示随快照保存的清单字段；技能文件 SKILL.md 头部的声明是另外采集的，如有会单独显示在「技能文件声明」中，不会覆盖或补入这里。

技能文件声明 47

下列内容是单独从各个技能文件（SKILL.md）在固定提交处的头部读取的，是文件自己写的声明文本，只作注解展示。它们与上方随快照保存的依赖、兼容要求（清单字段）分开保存，不会覆盖那些值；也不是包的许可证、版本、安装数或发布记录，且都没有经过核实。

证据范围与限制
  • 每一项只对应一个固定提交下的一个文件，字段状态只对这个文件成立。多个组件指向同一个文件时合并成一项；内容完全相同的文件共用一次提取结果。
  • 「文件中已声明」表示该文件头部写了这个字段。「此文件未声明」只在头部成功解析、且其中没有这个字段时出现。「声明无效」表示写了但类型、长度或字符不符合要求，不做改写或截断。「未读取」表示还没有读到可用的头部（尚未读取、读取失败、没有头部或头部无法解析），既不说明声明过，也不说明没声明过。
  • 兼容性与许可证文本是文件自述的原文，不代表实际可运行，也不是法律意见或许可证核验；metadata.version 只是文件内的注解，不是包版本，也不用于判断新旧。
  • 列表按记录的来源归并本版本的技能组件。列出的来源仍可能未固定提交、未读取或不可用，具体状态逐项显示。采集按限额分批进行，不保证全部读完。
  • 读取失败的文件会显示「可重试时间」，它只是采集器允许再次读取的时间，不是排期，也不保证会读取或完成。

第 1–20 项，共 47 个技能文件来源 · 截至

  1. plugin/skills/accessibility-aggregation/SKILL.md

    头部已解析

    使用这个文件的组件 1

    • accessibility-aggregation plugin/skills/accessibility-aggregation/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    此文件未声明头部已解析，其中没有这个字段；只对这个文件成立。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    此文件未声明头部已解析，其中没有这个字段；只对这个文件成立。
    metadata.version（文件注解）
    此文件未声明头部已解析，其中没有这个字段；只对这个文件成立。
    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    04557ab75996c8e1a12c19bfc0725e1759c4c9b9
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    头部已解析

    提取记录

    首次提取于 ，提取器版本 1。

    首次读取的来源
    与上面的文件相同。

  2. plugin/skills/batch-analysis/SKILL.md

    头部已解析

    使用这个文件的组件 1

    • batch-analysis plugin/skills/batch-analysis/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    此文件未声明头部已解析，其中没有这个字段；只对这个文件成立。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    此文件未声明头部已解析，其中没有这个字段；只对这个文件成立。
    metadata.version（文件注解）
    此文件未声明头部已解析，其中没有这个字段；只对这个文件成立。
    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    64deeb54b1b1d8e142a0e80554933e55f2e3e6ca
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    头部已解析

    提取记录

    首次提取于 ，提取器版本 1。

    首次读取的来源
    与上面的文件相同。

  3. plugin/skills/bioinformatics-installer/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • bioinformatics-installer plugin/skills/bioinformatics-installer/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    b41e3adb5c881946a260a6980eb44df2c6b5a289
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  4. plugin/skills/cellxgene-context/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • cellxgene-context plugin/skills/cellxgene-context/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    79de49419530ca1f52e879cde9516b30c32259ad
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  5. plugin/skills/cite-encode/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • cite-encode plugin/skills/cite-encode/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    d76ccb3d855cc039fc53a6f043c8637685d24ca1
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  6. plugin/skills/clinvar-annotation/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • clinvar-annotation plugin/skills/clinvar-annotation/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    6f1deb01f0e9fd657b0f65e69a2f783360e09ccc
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  7. plugin/skills/compare-biosamples/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • compare-biosamples plugin/skills/compare-biosamples/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    0e85e0c4f8b3f2acbb092d2ddae36be61531ea69
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  8. plugin/skills/cross-reference/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • cross-reference plugin/skills/cross-reference/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    f2944fd2c024547682fb8df9e66e9f3f62afe2a8
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  9. plugin/skills/data-provenance/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • data-provenance plugin/skills/data-provenance/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    716c10751bb3710fb23a3df4432fb94d3e07bb27
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  10. plugin/skills/disease-research/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • disease-research plugin/skills/disease-research/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    df84a3955b89450dd3e3e7aca71a732da988f1d0
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  11. plugin/skills/download-encode/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • download-encode plugin/skills/download-encode/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    ae81744b2a8aff3bd366ca1daaecf023e7ddd971
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  12. plugin/skills/ensembl-annotation/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • ensembl-annotation plugin/skills/ensembl-annotation/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    3e2c3a54e993ca266ab6ed4ddfa9e204c128b58e
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  13. plugin/skills/epigenome-profiling/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • epigenome-profiling plugin/skills/epigenome-profiling/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    170cabf64283c9f24f694f554a668c9484c030c5
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  14. plugin/skills/functional-screen-analysis/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • functional-screen-analysis plugin/skills/functional-screen-analysis/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    37889f1e2a7dfc749dce72723faeb36d2b773f5b
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  15. plugin/skills/geo-connector/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • geo-connector plugin/skills/geo-connector/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    8106b25241b1501b6404e6b58f9446eedab11e87
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  16. plugin/skills/gnomad-variants/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • gnomad-variants plugin/skills/gnomad-variants/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    9c880bcb39f624251231e2b25cdc3cfd816d2a10
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  17. plugin/skills/gtex-expression/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • gtex-expression plugin/skills/gtex-expression/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    951c8ce617c3a8508223e889430b591e38ff3575
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  18. plugin/skills/gwas-catalog/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • gwas-catalog plugin/skills/gwas-catalog/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    4d0f6939bd749f8e99f3917b8ee47a96edb61461
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  19. plugin/skills/hic-aggregation/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • hic-aggregation plugin/skills/hic-aggregation/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    5a925138f44fc6e51e49a94f8eda5a4a5102f2a3
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

  20. plugin/skills/histone-aggregation/SKILL.md

    未读取

    使用这个文件的组件 1

    • histone-aggregation plugin/skills/histone-aggregation/SKILL.md

    文件声明字段

    兼容性（文件声明）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    许可证文本（文件声明，未核验）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。
    metadata.version（文件注解）
    未读取没有可用的头部，既不说明声明过，也不说明没声明过。

    这个文件还没有可用的提取记录，三个字段都按「未读取」显示。

    仓库
    ammawla/encode-toolkit
    固定提交
    36836c8725fd4d20d9c851ce314f5151aea5f57c
    文件身份
    已记录普通文件身份
    blob SHA
    abcde7d757cd812e19faf7291494481d06768287
    模式
    100644
    身份记录时间
    头部解析
    未读取
    未读取原因
    文件身份已记录，但内容还没有读取。 declaration_unread

    尚无提取记录。

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